Άλλη δουλειά το ένα, άλλη το άλλο.
Το απορρυπαντικό δεν το χρειάζεσαι, φτάνει στεγνό καθάρισμα.
Ουσιαστικά το "apt-get autoremove" απεγκαθιστά πακέτα τα οποία ήταν εξαρτήσεις άλλων πακέτων που έχεις αφαιρέσει και δεν χρειάζονται πλέον.
Έγκειται στην καλή λειτουργία του package manager να γίνει σωστή απεγκατάσταση των εξαρτήσεων. Το έχω κάνει σε debian servers χωρίς πρόβλημα αρκετές φορές, αλλά στο ubuntu δεν μου έχει τύχει να το χρησιμοποιήσω.